L' Ecole s'appelait à sa création : Atelier Intercommunal de Musique des Cantons de Vercel et Pierrefontaine.
Elle a vu le jour en 1988 et elle était déjà intercommunale, grâce à une charte qui liait les deux cantons. C'est d'ailleurs la première école de musique à avoir fonctionné de cette façon. Dès la première année, elle réunissait une centaine d' élèves, preuve d'un réel besoin de la population.
Plus de cent concerts et auditions ont été donnés en milieu rural depuis sa création. Ces manifestations alliant de jeunes instrumentistes à des artistes confirmés ont vu une participation grandissante du public.
Après l' assemblée générale d' octobre 2005, l' Atelier Intercommunal de Musique, prend le nom d'Ecole de Musique Intercommunale des Portes du Haut Doubs.
Quelques élèves poursuivront une carrière musicale comme musicien dans les harmonies locales, musicien d'orchestre, enseignant, luthier, réparateur d'instruments, accordeur de piano ou ingénieur du son.